После Второй мировой войны он основал социально-педагогический факультет, которым руководил до 1948 г. Одновременно прилагал много усилий для открытия международного университета в г. Бремене, работал над реализацией оригинальных идей по созданию «автономной от общества» педагогики. В 1948 г. Петерсену предложили возглавить Йенского университета, однако в силу возраста и здоровья он отказался. 21 марта 1952 П. Петерсена не стало.